Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms