Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHKBQ93100 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHKBQ93100 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PHKBQ93100 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHKBQ93100 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms