Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLEC4DQ8WXI8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLEC4DQ8WXI8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLEC4DQ8WXI8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms