Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA2

PATE1, Prostate and testis expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE1Q8WXA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATE1Q8WXA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATE1Q8WXA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PATE1Q8WXA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms