Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOMQ8WWX9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SELENOMQ8WWX9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SELENOMQ8WWX9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SELENOMQ8WWX9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms