Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC4Q8WW27 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC4Q8WW27 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOBEC4Q8WW27 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOBEC4Q8WW27 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms