Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TRIM41Q8WV44 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.76■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
TRIM41Q8WV44 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.65■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
TRIM41Q8WV44 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TRIM41Q8WV44 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
TRIM41Q8WV44 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
TRIM41Q8WV44 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms