Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBASH3BQ8TF42 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBASH3BQ8TF42 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3BQ8TF42 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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