Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD8Q8NEN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD8Q8NEN9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD8Q8NEN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms