Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHDHQ8NE62 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHDHQ8NE62 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHDHQ8NE62 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms