Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PNLDC1Q8NA58 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PNLDC1Q8NA58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PNLDC1Q8NA58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms