Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STAG2Q8N3U4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
STAG2Q8N3U4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
STAG2Q8N3U4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms