Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMTC2Q8N394 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMTC2Q8N394 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMTC2Q8N394 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMTC2Q8N394 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
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