Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC116Q8IYX3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC116Q8IYX3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.3 ms