Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NPAS3Q8IXF0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPAS3Q8IXF0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPAS3Q8IXF0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPAS3Q8IXF0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms