Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KNDC1Q76NI1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KNDC1Q76NI1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
KNDC1Q76NI1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
KNDC1Q76NI1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms