Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BBS12Q6ZW61 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS12Q6ZW61 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS12Q6ZW61 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms