Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC141Q6ZP82 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CCDC141Q6ZP82 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CCDC141Q6ZP82 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC141Q6ZP82 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC141Q6ZP82 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms