Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR88Q6ZMY6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR88Q6ZMY6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR88Q6ZMY6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms