Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLPSL2Q6UWE3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLPSL2Q6UWE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLPSL2Q6UWE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms