Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EFCAB12Q6NXP0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EFCAB12Q6NXP0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFCAB12Q6NXP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms