Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT39Q6A163 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT39Q6A163 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT39Q6A163 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT39Q6A163 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT39Q6A163 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT39Q6A163 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT39Q6A163 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT39Q6A163 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT39Q6A163 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms