Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROCCQ5TZA2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROCCQ5TZA2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CROCCQ5TZA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CROCCQ5TZA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms