Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTUD3Q5T2D3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms