Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC122Q5T0U0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC122Q5T0U0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC122Q5T0U0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms