Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM23BQ5SRD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIMM23BQ5SRD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM23BQ5SRD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms