Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NEXMIFQ5QGS0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NEXMIFQ5QGS0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NEXMIFQ5QGS0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NEXMIFQ5QGS0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms