Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COBLL1Q53SF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COBLL1Q53SF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COBLL1Q53SF7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COBLL1Q53SF7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms