Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACSM3Q53FZ2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSM3Q53FZ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSM3Q53FZ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms