Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNPTABQ3T906 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GNPTABQ3T906 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GNPTABQ3T906 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GNPTABQ3T906 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms