Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ISXQ2M1V0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ISXQ2M1V0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISXQ2M1V0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms