Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MICAQ29983 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MICAQ29983 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MICAQ29983 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MICAQ29983 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICAQ29983 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICAQ29983 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICAQ29983 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICAQ29983 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICAQ29983 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICAQ29983 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICAQ29983 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MICAQ29983 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAQ29983 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAQ29983 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAQ29983 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAQ29983 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAQ29983 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MICAQ29983 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAQ29983 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAQ29983 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAQ29983 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MICAQ29983 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAQ29983 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAQ29983 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAQ29983 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAQ29983 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAQ29983 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MICAQ29983 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAQ29983 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAQ29983 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAQ29983 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAQ29983 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAQ29983 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MICAQ29983 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAQ29983 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAQ29983 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAQ29983 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAQ29983 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAQ29983 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAQ29983 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MICAQ29983 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAQ29983 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAQ29983 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAQ29983 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAQ29983 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAQ29983 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MICAQ29983 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MICAQ29983 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MICAQ29983 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MICAQ29983 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MICAQ29983 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MICAQ29983 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MICAQ29983 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MICAQ29983 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MICAQ29983 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICAQ29983 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICAQ29983 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MICAQ29983 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICAQ29983 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MICAQ29983 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MICAQ29983 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms