Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCK2Q16822 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCK2Q16822 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCK2Q16822 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCK2Q16822 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCK2Q16822 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCK2Q16822 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCK2Q16822 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCK2Q16822 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCK2Q16822 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCK2Q16822 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCK2Q16822 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCK2Q16822 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCK2Q16822 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCK2Q16822 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCK2Q16822 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCK2Q16822 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCK2Q16822 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCK2Q16822 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCK2Q16822 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCK2Q16822 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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