Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC85BQ15834 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC85BQ15834 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC85BQ15834 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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