Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC39.56■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
SHROOM2Q13796 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SHROOM2Q13796 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
SHROOM2Q13796 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
SHROOM2Q13796 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHROOM2Q13796 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
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