Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1orf61Q13536 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf61Q13536 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf61Q13536 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
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