Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP2Q13309 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKP2Q13309 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKP2Q13309 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms