Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAF3Q13114 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3Q13114 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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