Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM32Q13049 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM32Q13049 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM32Q13049 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM32Q13049 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM32Q13049 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM32Q13049 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM32Q13049 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM32Q13049 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM32Q13049 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM32Q13049 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM32Q13049 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM32Q13049 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM32Q13049 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM32Q13049 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRIM32Q13049 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM32Q13049 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM32Q13049 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM32Q13049 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM32Q13049 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM32Q13049 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM32Q13049 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM32Q13049 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM32Q13049 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM32Q13049 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM32Q13049 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM32Q13049 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM32Q13049 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM32Q13049 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM32Q13049 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
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