Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YPL014WYPL014W 1146 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 DRS1YLL008W 2259 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 WTM1YOR230W 1314 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 RCK1YGL158W 1539 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 MHR1YDR296W 681 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 APT2YDR441C 546 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 YJL171CYJL171C 1191 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 DOM34YNL001W 1161 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 CUP9YPL177C 921 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 UBA3YPR066W 900 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-DR3Q12441 RMD1YDL001W 1293 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 PRE1YER012W 597 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 RPB4YJL140W 666 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YSR3YKR053C 1215 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 XYL2YLR070C 1071 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 INP1YMR204C 1263 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 NSG2YNL156C 900 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 CPR8YNR028W 927 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 RRT8YOL048C 1029 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 IRC11YOR013W 471 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 APA1YCL050C 966 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 MSB4YOL112W 1479 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SLS1YLR139C 1932 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 CEG1YGL130W 1380 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 BEM1YBR200W 1656 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SHO1YER118C 1104 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 AIM22YJL046W 1230 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 ESS1YJR017C 513 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 CKB2YOR039W 777 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SME1YOR159C 285 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 HIS3YOR202W 663 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 TAF3YPL011C 1062 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YMC2YBR104W 990 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 IES1YFL013C 2079 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 GGC1YDL198C 903 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 OYE2YHR179W 1203 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YJR149WYJR149W 1215 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SWD1YAR003W 1281 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 ATG16YMR159C 453 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 ARA1YBR149W 1035 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 BPL1YDL141W 2073 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 KTR4YBR199W 1395 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 TPS1YBR126C 1488 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 PTR2YKR093W 1806 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 CTF3YLR381W 2202 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 NHP10YDL002C 612 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YDL016CYDL016C 303 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 RSA1YPL193W 1146 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 ECM10YEL030W 1935 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 NDE1YMR145C 1683 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YER137CYER137C 447 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 STS1YIR011C 960 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 RCN1YKL159C 636 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YLR156WYLR156W 345 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YLR159WYLR159W 345 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YLR161WYLR161W 345 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 MFT1YML062C 1179 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 MRPS17YMR188C 714 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YNL017CYNL017C 339 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YNR064CYNR064C 873 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YOR300WYOR300W 309 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SNF8YPL002C 702 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YPL162CYPL162C 822 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 RPL21AYBR191W 483 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YBR226CYBR226C 411 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 MTF2YDL044C 1323 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SAD1YFR005C 1347 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 TFC7YOR110W 1308 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 PRP19YLL036C 1512 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SPE4YLR146C 903 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SMD3YLR147C 306 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YBL062WYBL062W 381 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 ATO2YNR002C 849 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YPL264CYPL264C 1062 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 MET16YPR167C 786 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 MSS116YDR194C 1995 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 KGD2YDR148C 1392 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 ATG18YFR021W 1503 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 KEL3YPL263C 1956 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 PPH21YDL134C 1110 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YDR249CYDR249C 1122 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 RPN14YGL004C 1254 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 GMH1YKR030W 822 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 TMA23YMR269W 636 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YPL191CYPL191C 1083 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 YPR071WYPR071W 636 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 SRO9YCL037C 1305 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 VHS1YDR247W 1386 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 CRP1YHR146W 1398 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-DR3Q12441 GPM2YDL021W 936 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 snR86snR86 1004 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 IRC22YEL001C 678 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-DR3Q12441 MTC7YEL033W 420 nt7.14□□□□□ -1.27
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