Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RUNX1T1Q06455 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX1T1Q06455 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX1T1Q06455 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms