Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTDSPL2Q05D32 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTDSPL2Q05D32 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTDSPL2Q05D32 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTDSPL2Q05D32 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms