Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POU4F1Q01851 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POU4F1Q01851 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU4F1Q01851 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms