Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAP1Q01518 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAP1Q01518 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CAP1Q01518 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms