Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX5P78411 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX5P78411 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX5P78411 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX5P78411 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX5P78411 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX5P78411 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IRX5P78411 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
IRX5P78411 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX5P78411 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX5P78411 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX5P78411 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX5P78411 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IRX5P78411 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX5P78411 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IRX5P78411 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IRX5P78411 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IRX5P78411 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IRX5P78411 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IRX5P78411 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IRX5P78411 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX5P78411 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX5P78411 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IRX5P78411 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX5P78411 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX5P78411 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IRX5P78411 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IRX5P78411 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX5P78411 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX5P78411 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX5P78411 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IRX5P78411 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IRX5P78411 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX5P78411 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IRX5P78411 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IRX5P78411 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
IRX5P78411 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IRX5P78411 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
IRX5P78411 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
IRX5P78411 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX5P78411 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX5P78411 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX5P78411 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX5P78411 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX5P78411 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX5P78411 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX5P78411 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX5P78411 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX5P78411 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX5P78411 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX5P78411 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX5P78411 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX5P78411 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX5P78411 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX5P78411 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX5P78411 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX5P78411 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX5P78411 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX5P78411 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX5P78411 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX5P78411 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX5P78411 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX5P78411 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX5P78411 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX5P78411 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX5P78411 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX5P78411 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRX5P78411 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX5P78411 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX5P78411 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX5P78411 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX5P78411 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX5P78411 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX5P78411 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX5P78411 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX5P78411 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX5P78411 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX5P78411 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX5P78411 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX5P78411 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX5P78411 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX5P78411 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX5P78411 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX5P78411 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX5P78411 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX5P78411 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IRX5P78411 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX5P78411 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX5P78411 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX5P78411 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX5P78411 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IRX5P78411 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms