Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSNL1P62760 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSNL1P62760 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSNL1P62760 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms