Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3BP58499 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3BP58499 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM3BP58499 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms