Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB38P57729 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB38P57729 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB38P57729 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB38P57729 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB38P57729 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB38P57729 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB38P57729 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB38P57729 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB38P57729 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB38P57729 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB38P57729 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB38P57729 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB38P57729 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB38P57729 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB38P57729 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB38P57729 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB38P57729 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB38P57729 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB38P57729 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB38P57729 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB38P57729 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB38P57729 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB38P57729 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB38P57729 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB38P57729 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB38P57729 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB38P57729 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB38P57729 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB38P57729 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB38P57729 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB38P57729 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB38P57729 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB38P57729 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB38P57729 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB38P57729 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB38P57729 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB38P57729 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB38P57729 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB38P57729 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB38P57729 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB38P57729 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB38P57729 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB38P57729 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB38P57729 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB38P57729 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB38P57729 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB38P57729 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB38P57729 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB38P57729 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB38P57729 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB38P57729 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB38P57729 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB38P57729 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB38P57729 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB38P57729 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB38P57729 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB38P57729 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB38P57729 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB38P57729 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB38P57729 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB38P57729 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB38P57729 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB38P57729 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB38P57729 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB38P57729 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB38P57729 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB38P57729 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB38P57729 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB38P57729 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB38P57729 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB38P57729 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB38P57729 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB38P57729 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB38P57729 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB38P57729 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB38P57729 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB38P57729 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB38P57729 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB38P57729 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB38P57729 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB38P57729 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB38P57729 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms