Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRPF1P55201 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRPF1P55201 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRPF1P55201 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRPF1P55201 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
BRPF1P55201 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BRPF1P55201 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRPF1P55201 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRPF1P55201 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms