Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCKAP1LP55160 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCKAP1LP55160 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCKAP1LP55160 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCKAP1LP55160 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NCKAP1LP55160 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKAP1LP55160 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKAP1LP55160 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKAP1LP55160 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKAP1LP55160 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKAP1LP55160 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NCKAP1LP55160 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms